Investigadores de China e Alemaña descifraron completamente o xenoma da pataca por primeira vez, informa TASS. Isto axudoulles a desentrañar a historia evolutiva desta planta e destacar as rexións clave do ADN asociadas ao crecemento e á resistencia ás enfermidades. A información sobre isto foi publicada polo servizo de prensa do Instituto Alemán de Mellora Vexetal (IPZ).
"A secuenciación do xenoma da pataca permitiranos lanzar programas de reprodución de alto rendemento que crearán novas variedades de alto rendemento pero resistentes ao quecemento global, o que será fundamental nas próximas décadas", dixo o profesor do IPZ Korbinian Schneeberger.
Moitas enfermidades fúngicas e bacterianas interfiren co cultivo da pataca, así como varias pragas como o escaravello da pataca de Colorado e os nematodos. Científicos e criadores intentan combatelos creando novas variedades de patacas convencionais e modificadas xeneticamente.
O profesor Schneeberger e os seus colegas atoparon unha solución potencial a este problema nun proxecto masivo destinado a secuenciar completamente o xenoma da pataca. No pasado, os científicos xa intentaron obter esta información, pero isto viuse obstaculizado pola estrutura extremadamente complexa do xenoma da pataca: consta de catro conxuntos idénticos de cromosomas que conteñen un gran número de repeticións.
As novas tecnoloxías de secuenciación de ADN e os algoritmos para analizar a información xenética axudaron aos xenetistas alemáns e chineses a resolver este problema para a variedade Otava. Para descifrar o xenoma, os científicos recolleron un gran número de grans de pole, cuxo material xenético só contén dúas, non catro copias dos cromosomas.
Este enfoque simplificou moito a tarefa, pero ao mesmo tempo requiría a decodificación dun número moi grande de fragmentos de ADN e a súa posterior combinación mediante algoritmos informáticos. Finalmente, os científicos obtiveron unha copia virtual do xenoma completo da pataca, que consta de aproximadamente 3,1 millóns de "letras" xenéticas: nucleótidos e que contén máis de 38 xenes.
A análise posterior da súa estrutura revelou a complexa historia evolutiva da pataca. Os científicos descubriron que esta cultura sobreviviu recentemente á duplicación do xenoma como resultado da endogamia. Ademais, os científicos descubriron diferenzas pouco habituais no nivel de actividade das copias dos mesmos xenes localizados en diferentes cromosomas, que poden afectar a eficiencia de cruzar diferentes variedades de pataca.
Esta información, esperan os científicos, axude a criar novas variedades ou modificar o xenoma de forma que as patacas medren máis rápido, resistan mellor o tizón tardío e outras enfermidades e tamén sexan menos susceptibles a varios factores de estrés.